Расценка ЖНВЛП происходит по формуле, которая зависит от системы налогообложения вашей аптеки. Установить выбор верной формулы нужно в разделе Настройки - Работа с накладными
Контроль превышения наценки поставщиком
Расценка по товарным группам
Настройка расценки по шаблону фиксированных цен описана здесь. Информация о том, как настроить шаблоны фиксированных цен описана по ссылке тут.